Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms