Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms