Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RhoP15409 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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RhoP15409 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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RhoP15409 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RhoP15409 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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RhoP15409 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RhoP15409 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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