Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ssxb8B1AY40 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Ssxb8B1AY40 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Ssxb8B1AY40 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Ssxb8B1AY40 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Ssxb8B1AY40 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Ssxb8B1AY40 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ssxb8B1AY40 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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