Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17190V9GX38 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17190V9GX38 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17190V9GX38 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17190V9GX38 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17190V9GX38 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17190V9GX38 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17190V9GX38 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17190V9GX38 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm17190V9GX38 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17190V9GX38 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17190V9GX38 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm17190V9GX38 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm17190V9GX38 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gm17190V9GX38 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gm17190V9GX38 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gm17190V9GX38 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm17190V9GX38 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm17190V9GX38 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm17190V9GX38 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm17190V9GX38 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm17190V9GX38 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm17190V9GX38 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17190V9GX38 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms