Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Letm1Q9Z2I0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Letm1Q9Z2I0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms