Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp1Q9Z273 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms