Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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