Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms