Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccne2Q9Z238 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms