Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms