Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ap3b1Q9Z1T1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ap3b1Q9Z1T1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms