Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms