Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms