Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shcbp1Q9Z179 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms