Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne6Q9Z140 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms