Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Itgb6Q9Z0T9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb6Q9Z0T9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms