Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cldn13Q9Z0S4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn13Q9Z0S4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn13Q9Z0S4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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