Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapaQ9WV55 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapaQ9WV55 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms