Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx9Q9WUH2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx9Q9WUH2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx9Q9WUH2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx9Q9WUH2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx9Q9WUH2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx9Q9WUH2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx9Q9WUH2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx9Q9WUH2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx9Q9WUH2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx9Q9WUH2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx9Q9WUH2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx9Q9WUH2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx9Q9WUH2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx9Q9WUH2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms