Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms