Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkraQ9WTX2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkraQ9WTX2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms