Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nfe2l3Q9WTM4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms