Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trpc2Q9R244 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpc2Q9R244 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms