Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms