Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Abcc6Q9R1S7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcc6Q9R1S7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc6Q9R1S7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms