Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms