Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod1Q9R0E2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms