Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms