Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms