Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf4Q9QZS2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf4Q9QZS2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms