Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col4a3Q9QZS0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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