Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Npas3Q9QZQ0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms