Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ercc4Q9QZD4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ercc4Q9QZD4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms