Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn8Q9QZ49 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ubxn8Q9QZ49 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms