Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Map1aQ9QYR6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms