Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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Rdh11Q9QYF1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh11Q9QYF1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Rdh11Q9QYF1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Rdh11Q9QYF1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Rdh11Q9QYF1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rdh11Q9QYF1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms