Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapbQ9QY76 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms