Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms