Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nufip1Q9QXX8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms