Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms