Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trip4Q9QXN3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip4Q9QXN3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms