Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad18Q9QXK2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad18Q9QXK2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad18Q9QXK2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad18Q9QXK2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad18Q9QXK2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad18Q9QXK2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad18Q9QXK2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad18Q9QXK2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad18Q9QXK2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms