Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apbb1Q9QXJ1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms