Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hacl1Q9QXE0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms