Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Homer2Q9QWW1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Homer2Q9QWW1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms