Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mid2Q9QUS6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms