Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms