Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfmbt1Q9JMD1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms