Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms